Asociace souborů
Ve Windows může instalační program zaregistrovat Markzen jako obslužný program pro typy značkovacích souborů, které čte — Markdown, AsciiDoc, reStructuredText, Org, Textile a Djot. Po registraci dvojklik na jeden z těchto souborů v Průzkumníkovi jej otevře přímo v Markzen, a pokud je nainstalováno několik editorů, stále můžete zvolit Markzen přes „Otevřít v programu…“.